УДК: 615.015.11:544.165:575.112::[544.187.2+519.237.4]

Спектр энергий множественного докинга как многомерная метрика аффинности химических соединений к фармакологически релевантным биомишеням

П. М. Васильев, А. Н. Кочетков, А. А. Спасов, М. А. Перфильев

Волгоградский государственный медицинский университет, Научный центр инновационных лекарственных средств, Россия

Резюме

Изложена основная гипотеза множественного докинга и описан алгоритм формирования совокупности пространств для его проведения. Выполнен простой и множественный докинг известных ингибиторов RAGE (рецептор конечных продуктов гликирования). Рассчитаны энергии простого докинга и спектры энергий множественного докинга этих соединений. Методом однофакторного дисперсионного анализа и дискриминантного анализа показано, что матрица энергий множественного докинга является статистически намного более значимой метрикой аффинности лигандов к фармакологически релевантным биомишеням, чем вектор энергий простого докинга.

Ключевые слова

n silico, множественный докинг, спектр энергий, аффинность лигандов, биомишень, многомерная метрика, ANOVA, дискриминантный анализ

Контакты